1.综合办公室
负责集团行政综合事务、信访外事工作、保密工作，以及集团档案管理和总部机关档案收集管理，西北地区放射性矿产地质档案资料的管理等。
2.党委工作部
负责落实集团公司党的建设，中层领导人员管理，共青团和青年工作，统战工作及扶贫工作。
3.宣传部
负责落实集团新闻宣传及其阵地建设，意识形态管理工作，思想政治工作研究、精神文明建设和企业文化建设。
4.发展规划部
负责编制集团公司中长期发展战略规划及投资计划，并组织落实战略措施。
组织集团公司投资项目及二级子公司重大投资项目的管理。
5.财务会计部
负责集团公司全面资产管理、财政经费管理、财务内控体系与制度建设、全面预算决算和财务监督工作。
加强集团会计核算和资金集中管理。
做好筹融资业务管理和税务管理工作。
6.企业管理部
负责集团年度经营目标、日常经营、制度管理等经营管理事项。
组织对集团所属单位年度经营目标完成情况的监督考核。
7.人力资源部
负责集团人力资源的规划管理、员工招聘调配与管理、教育培训与职称评审、薪酬福利、社保及离退休管理和集团公司事业编制员工管理工作等。
8.地质矿业部
负责集团公司地质项目、探矿权资源管理和矿业资源开发管理工作。
组织重大科研项目和生产技术攻关项目论证，为决策提供依据。
负责新疆维吾尔族自治区地质勘查及其延伸项目相关资讯收集及申报。
9.安全环保部
负责集团生产安全、应急救援和内保管理。
做好集团环境保护及节能减排管理和考核。
负责集团公司放射源的管理工作。
10.核工业西北放射性矿产地质管理办公室秘书办（特设机构）
负责协助中核集团地矿事业部管理原西北10个大队在西北地区军工铀矿地质勘探设施的退役治理各项工作。
负责与陕西省政府联系的事宜。
11.科技信息与核技术应用部
负责集团公司科技创新、网络安全、质量管理和信息化管理工作。
负责集团公司核能与核技术利用相关事项的管理工作。
通过科技创新、网络安全和信息化建设，提升集团公司信息化条件下的核心竞争力。
12.纪检综合室
主要履行综合管理、信访举报问题线索分办转办、案件审理等职能。
13.纪检监察室
主要履行监督检查、执纪审查和依法调查处置的职能。
14.审计与法规部
负责集团内部审计、风险防范和责任追究工作。
负责集团公司重大事项的政策法规论证、法律尽职调查和法律风险提示与防范。
负责集团公司合同及对外文件的合规性审查（核）。
推进集团公司及所属单位法律风险管理体系建设和集团公司诉讼案件及其他法律纠纷的处理。
15.医药发展部
负责编制集团公司医疗、制药等业务的中长期发展规划、年度工作计划及重点工作任务、初步筛查管理范围内各子公司的投资项目、制定完善相关配套管理制度。
负责研究国内外医药产业相关专业新技术，协调相关产业公司间的内部合作，定期调研业务内各子公司并给予日常指导工作。
16.工会办
负责职代会及工会的日常工作，维护职工的合法权益，开展职工福利和互助互济等工作，履行集团公司劳动竞赛委员会职责。
17.巡察办
主要负责统筹、协调、指导、管理各项巡察督导工作。
